cDNA和transcripts的区别

CDS和cDNA之间的关键区别在于，CDS或编码序列是转录本中实际翻译成蛋白质的部分，为转录本

而cDNA序列是通过反转录从mRNA中衍生出来的DNA序列。cDNA是通过反转录从mRNA获得的DNA序列。为DNA序列

gtf文件中转录本的正负链：

+:代表转录本的位置是与基因组一样的

-：代表从与基因组上位置互补的一条链上转录出来的，其位置与基因组的位置要从数字更大的基因组坐标到数字更小的基因组坐标

基因的cds和orf的区别

先大致说一下区别，DNA中有基因和基因间区，而基因中包含编码区和非编码区，编码区中有内含子和外显子，转录成RNA时候，高等生物发生转录时，都会将内含子等基因片段转录的RNA片段经过修饰切除，而保留外显子所转录出来的RNA片段，这个片段就是你提到的从供体中提取出的RNA片段。

直接提取的DNA可供给高等生物，而提取RNA反转录为cDNA可供给高等生物或微生物，因为微生物中没有我上一段落所说的修饰切除作用。

CDS是Coding sequence，蛋白编码序列。

ORF是open reading frame，开放阅读框。

⑴开放阅读框是不被终止子打断的一段核酸序列，可能包含编码蛋白的碱基序列；不是所有开放阅读框都能被表达出蛋白产物，或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白。

⑵CDS，就是编码一段蛋白产物的序列。

⑶cds必定在一个ORF里，但也可能包括很多ORF。

⑷反之，每个ORFf不一定都有CDS。

PS：百度百科上的说法略有出入，我改了改